南阳医专中医系2006年9月成立，专业课教师65人，其中“双师型”教师54人，教授10人，主任医师4人，副教授27人，讲师及以下28人；博士3人，硕士24人，本科38人； 40岁以下青年教师13人，全部为硕士以上学位，教师队伍的年龄、学历、职称、学缘结构合理。《中医内科学》、《中药学》、《中医诊断学》为校级精品课程。2008年7月中医学教学团队被确定为省级教学团队立项建设项目，2010年4月中医学专业被确定为省级特色专业。

拥有全国优秀中医临床人才3人，省中医重点人才2人，市级专业技术带头人12人。近5年来主持完成省级科研项目8项，市级科研成果30余项，获得省级重点教改项目立项1项，出版论著48部，参编中医药规划教材20余种，发表论文200余篇。

中医系开设有本科、专科层次中医学专业和专科层次中医养生保健专业。毕业生分布全国各地，绝大多数已成为医药卫生部门的骨干力量，其中300余名已获得硕士或博士学位，近年来优秀应届毕业生升入本科的升学率一直稳定在90%以上。

中医系现设5个教研室：中医基础教研室、方药教研室、中医内科教研室、中医外科教研室、中医妇儿教研室；中西医基础及临床技能实训室功能齐全；建有1000平方米的国内一流的中药标本馆；三所附属医院床位2600张，可以满足学生见习、实习需要；在省内外建有32家稳定的实习基地。

中医系始终站在培养社会主义合格建设者和可靠接班人的高度，注重师生思想道德建设，坚持贯彻以教学为中心，以学生为本的办学思想，重视素质教育和学生实践动手能力的培养。教学突出中医特色，注重与现代医学教育结合，力争使每一名毕业生都能成为“崇仁、厚德、恒志、精术”德技双馨的“仲景学子”。